Prof. Dr. Ayşe Selimoğlu tıp eğitimini Atatürk Üniversitesi’nde tamamladıktan sonra çocuk sağlığı ve hastalıkları alanındaki uzmanlık eğitimi 1994 senesinde aynı üniversitesinde tamamlamıştır. Daha sonrasında pediatrik gastroenteroloji ve beslenme alanındaki uzmanlık eğitimini 1998 yılında Eğe Üniversitesi’nde tamamladıktan sonra gözlemci akademisyen olarak Pittsburgh Çocuk Hastanesinde 2011 yılında bulunmuştur.
1995 ile 2000 yılları arasında yardımcı doçent unvanı ile Atatürk Üniversitesi’nde görev alan Prof. Dr. Ayşe Selimoğlu 1999 ile 2005 yılları arasında ise aynı üniversitede pediyatrik gastroenteroloji, hepatoloji beslenme bölüm başkanlığı görevini yürütmüştür. Bu süre içerisinde doçent unvanını da alan Prof. Dr. Ayşe Selimoğlu2006 ile 2018 yılları arasında İnönü Üniversitesi’nde profesör unvanını almış ve bu üniversitede bölüm başkanlığı ve anabilim dalı başkanlığı görevlerinde bulunmuştur. Prof. Dr. Ayşe Selimoğlu 2018 yılından bu yana ise hem Memorial Ataşehir hem de Memorial Bahçelievler hastanelerinde profesör doktor olarak görevine devam etmektedir.