Prof. Dr. Ömer Göktekin tıp eğitiminin 1992 yılında İstanbul Üniversitesi Cerrahpaşa Tıp Fakültesi’nde tamamladıktan sonra kardiyoloji alanındaki uzmanlık eğitimini 1997 yılında Dr. Siyami Ersek Göğüs Kalp ve Damar Cerrahisi Eğitim ve Araştırma Hastanesi'nde tamamlamıştır.Prof. Dr. Ömer Göktekin doçentlik unvanını 2003 yılında alırken profesörlük unvanı ise 2008 yılında almıştır.
Prof. Dr. Ömer Göktekin meslek hayatına 1997 ile 1999 yılları arasında görev aldığı Vakıf Gureba Hastanesi'nde kardiyoloji uzmanı olarak başladıktan sonra 1999 ile 2010 yılları arasında Osmangazi Üniversitesi'nde öğretim üyesi görevinde bulunmuştur. 2011-2017 yılları arasında Bezmialem Vakıf Üniversitesi Tıp Fakültesi’nde kardiyoloji anabilim Dalı başkanlığı yapan Prof. Dr. Ömer Göktekin daha sonrasında 2017 ile 2018 yıllarında Memorial Hizmet Hastanesi'nde kardiyoloji uzmanı olarak görev almıştır. Prof. Dr. Ömer Göktekin 2018 yılından bu yana ise Memorial Bahçelievler Hastanesi'nde kardiyoloji uzmanı olarak hastalarına hizmet vermektedir.
Ömer Bey kardiyoloji branşında görev yapmaktadır.
Ömer Bey, Memorial Bahçelievler hastanesinde görev yapmaktadır.
Ömer Göktekin, taşikardi, kalp kapağı problemleri, damar tıkanlıklığı, tavı, koroner anjiyoplasti, hipertansiyon, cabg hastalıkları ve tedavileri ile ilgilenmektedir.